Πίσω από τις ειδήσεις και τα μεγάλα γεγονότα βρίσκονται πάντα ανθρώπινες στιγμές. Στιγμές που καθόρισαν την πορεία ενός γεγονότος, που σημάδεψαν ζωές ανθρώπων, που χάραξαν ακόμα και την ιστορία. Αυτές τις στιγμές επιχειρεί να αναδείξει η εκπομπή «365 Στιγμές» με τη Σοφία Παπαϊωάννου, φωτίζοντας μεγάλα ζητήματα της κοινωνίας, της πολιτικής, της επικαιρότητας και της ιστορίας του σήμερα. Με ρεπορτάζ σε σημεία και χώρους που διαδραματίζεται το γεγονός, στην Ελλάδα και το εξωτερικό. Δημοσιογραφία 365 μέρες τον χρόνο, καταγραφή στις «365 Στιγμές».

Το 1964, δύο ελληνικά πολεμικά πλοία, το «Φαέθων» και το «Αρίων», ξεκίνησαν από την Ελλάδα μυστικά για να μεταβούν στην Κύπρο να βοηθήσουν τους Ελληνοκύπριους στον αγώνα τους κατά των Τούρκων.
Συμμετείχαν σε μάχες, δέχτηκαν βομβαρδισμό με βόμβες Ναπάλμ από την τουρκική αεροπορία, είχαν τραυματίες και νεκρούς. Η μυστική αποστολή έμεινε απόρρητη για 52 χρόνια και κανείς δεν μπορούσε να μιλήσει γι’ αυτό. Για το ελληνικό κράτος «αυτά τα πλοία δεν υπήρξαν ποτέ».

Στην εκπομπή «365 στιγμές» με τη Σοφία Παπαϊωάννου μιλούν για πρώτη φορά οι εν ζωή αξιωματικοί του πλοίου «Φαέθων», καθώς και ο κυβερνήτης και επικεφαλής αυτής της μυστικής και άγνωστης αποστολής.